本作にはさまざまな趣向がこらされている。たとえばダンジョン内に落ちているメモリーチップ。これを集めると、メガドライブ版に登場した悪魔を呼び出すことが可能だ。そしてクリア後には、隠しダンジョンに「コロシアムモード」が出現する。このモードでは「パーティバトル」「シングルバトル」「サバイバル」という3種類の戦闘方式を選ぶことができ、そこで負けるとレベルが下がるなどのペナルティも課せられる。
前作のGBA版『真・女神転生』との通信ケーブルを使っての「ビジョナリーモード」では、本編の中では語られることのなかったキャラクターの謎を短編のイベントのように紹介してくれる。本作では「不完全な記憶の欠片(ビジョナリーアイテム)」が追加されており、前作とゲーム内の鑑定屋を介して通信することにより、「完全な記憶の欠片」として修復するギミックを楽しむことができる。もちろん本作同士で悪魔やメモリーチップを交換することも可能だ。(林田信浩)