エースコンバット2の再編成ということでミッションの内容も2と比べると攻略法が変わっていたりするが、一部ミッションがカットされていたり今作初登場のミッションもある。
また、任意で発動できる「マニューバ」の導入によってシリーズ初心者にも難しすぎないと思われる。

機体の挙動は重めだが、カスタマイズによっては「3」「5」に近い操縦性を得ることもできる。
「2」には収録されていなかったフツーのF-15が今作には収録されている。

ゲームモードは「ストーリーモード」「チャレンジモード」「データビュアー」。
チャレンジモードにはシリーズ恒例のフリーミッション、ACE5のアーケードモードの派生であるサバイバルミッション、高難度のエクストラミッションの3種類がある。これらのミッションでしか聴けない無線やBGMも存在する。
尚、フリーフライト、離着陸、発着艦、空中給油イベントは割愛されているが、その分もらえる勲章は比較的多め。おなじみのネームド機も。
機体カラーはその経験値に応じて増えていき、RGB値で指定してカスタマイズ可能なものもある。