システムソフト・アルファーは本日（2011年11月9日），ニンテンドー3DS用ソフト「萌え萌え大戦争☆げんだいばーん 3D」を，12月15日に発売すると発表した。価格は6090円（税込）で，CEROレーティングはD（17歳以上対象）。

3DS版には，オリジナル版に，新たなシナリオを3本追加，また，ほかのプラットフォームにはない特殊スキルが追加されているほか，3DSならではのスライドパッドやタッチペンの操作にも対応している。ダメージを負った鋼の乙女を修復できるコミュニケーションパートでは，乙女達をタッチペンで“こすったり強くつついたり”することで修理が行えるという点も，なかなかにそそるポイントである。

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