讃洲中学2年、結城友奈。
明るくて前向き、元気いっぱいなこの少女は、“みんなのためになる事を勇んで実行するクラブ”『勇者部』に所属する普通の女の子。3年生の先輩・犬吠埼風を中心としたこの勇者部の活動内容は“子猫の里親探し”や“保育園のお手伝い”など、みんなのためになる事全般。
――だけど彼女たち勇者部には、人には知られていない本当の使命があるのです。
それは普通の人々の知らない空間、『樹海』を伝って侵攻して来る不思議な存在『バーテックス』との戦い。“樹海”に入り、人類の世界を終わらせようと侵攻してくるこの敵と戦えるのは、選ばれた勇者たちのみ。
……のはずだったのに、なんだかここ最近、樹海の様子がちょっと違うみたい……?
勇者とバーテックスだけが行動できるはずの樹海で出会う、不思議な存在とは――?