いますぐお兄ちゃんに妹だっていいたい！

親同士の再婚で、『三谷陸斗』と『三谷歩夢』は兄妹になりました。
お母さんのいいつけで、歩夢は兄・陸斗の前でだけ男の子を演じることになります。
相部屋生活はハプニングの連続で、あまりに可愛すぎる弟（本当は妹）に陸斗はドキドキしっぱなしの毎日です。
歩夢は一生懸命男の子としてふるまいますが、陸斗の優しさに触れるにつれ、隠しごとをしていることに胸を痛めていきます。

春。陸斗と歩夢は、高藤学園と人気を二分する人気校「朝岡学園」に通いはじめます。
女の子としてのアイデンティティを見失いかけている、陸斗の中学時代からの盟友『奈々瀬奉莉』。
正真正銘の女子なのに、男子生徒として学園に通う『茂森真央』。
内気すぎる自分を変えたいと願う、クラス委員長の『拝田希実花』。
同じクラスになり彼女たちと仲良くなるにつれ、陸斗は気づきはじめます。
彼女たちがなくしてしまったカケラに。

そして陸斗たちは、カケラを探し求め、歩き出します――。