これはいろんなサイトに書いてある情報や、自分で発見したのなど色々です。
僕も役に立った情報なので、ぜひ見てください。順番はバラバラです。すいません。
ほかにも役に立つ情報があれば追加していきます。
 
・ヒンバス  ナギサシティに行く道、222番道路の船乗りがもっている。
       必ず戦うのでそこまで行っていない人以外は埋まっているはず。
 
・ミノマダム トバリシティの下の道、214番道路の大人のお姉さんが持っている。
       (大人のお姉さんは金髪です。)

・ポッタイシ ポッチャマを進化させたくない人は
       212番道路の角(マップでみると90度になっている角らへん)
       にいる、ポケモンレンジャーが持っている。
       ヨスガシティからいくと行きやすい。
       二人で道を縦にはさんでいて
       エリートトレーナーに似ている人たち。

・ディアルガ(パールの場合)
 パルキア (ダイヤモンドの場合) 
      これはトレーナーが持っているわけではありませんが
      やりのはしらに行った後、カンナギタウンの長老の家
      (横長の家)に行って、おばあさんに話しかけると
      本を見せてくれるそこに載っている。
      これで登録できる。

・クロバット やりのはしらでアカギの手持ちにいる

・フーディン 四天王ゴヨウの手持ちでも見られますが、
       波乗りの裏ワザを使って殿堂入りした人は
       埋まっていないかもしれません。
       通信交換で友達からでもユンゲラーをもらってください。
       すると・・・!進化します!

・ミカルゲ  これもチャンピョンシロナの手持ちでも見られますが、
       波乗りの裏ワザでは登録されないので
       もう一回チャンピョンまで見に行くのはかなりめんどくさいです。
       216番道路にいる空手王(戦いません)に話しかけて
       かなめ石をもらう。すぐ右にあるみたまのとうにはめる。
       地下通路で友達と通信をしてトレーナーカードを見せる。
       実際は32人の友達と話さなければいけないが、
       自分と友達一人でできる。やり方は、まず普通に地下に入って
       自分からトレーナーカードを見せあいっこしようと誘う。
       すると、出会った人の人数が1になる。
       (いままで0人だった場合)
       そうしたら自分だけでいいのでもう一回地上に戻る。
       地下に入る。自分からトレーナーカードを見せあいっこしようと誘う。
       出会った人の人数が1増える・・・を三十二回繰り返せば
       友達一人だけでできる。ちなみに一回地上に上がらないと
       出会った人の人数は変わらないし、相手から誘われても増えない。

・フワンテ  これは知っていると思います。
       谷間の発電所でお父さん(近くにいる子供の)を助けてから
       毎週金曜日に一体ずつ発電所の前に現れます。

・チリーン  やりのはしらに行く道で野生で出現します。
       リーシャンを持っていたら、夜になつき進化させるとよいでしょう。

・フカマル  サイクリングロードの下の道に行く。
       そして上へ進む。すると、洞窟の入口が見えるがそこには入りません。
       ちょうどサイクリングロードの下にあって見えませんが、
       一個一個確かめていくと岩と岩の間に道ができているのがわかる。
       その道の先に迷いの洞窟の入口がある。この先にしか
       フカマルは生息していない。中に入ると、怪力でおせる岩がある。
       それをどかして進めばフカマルと会える。
       ちなみに怪力で囲まれている一マスには出てこない。

       まだまだ追加していくので待っていてください。
       


結果

図鑑を埋めるのに役立つ!?(役立てたら嬉しい)


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