1929年、突如として大勢の人々が
人ならざる者【キメラ】に変化する怪現象が発生する。
原因は過去に落下した、
通称【ブラックガーネット】と呼ばれる隕石が
もたらした未知のウイルスによるものだった。
【キメラウイルス】と名付けられたウイルスは
世界的パンデミックを引き起こし、
人類は総人口の3%を失う事となる。
この非常事態に国は“鎖国”という方針をとり
外部からのウイルス侵入を遮断、
更に国内に残るキメラ迎撃のため
【特務機関ACID】が組織される。
そして時は流れ、特務機関ACIDは今なお
人を脅かすキメラを撲滅する為、
特殊部隊ワルキューレを創設する。