ボスについて

ランチャー･オクトパルド：マリントルネードからのライフ吸収がかなりやっかい。エクストリームでは、地面をすべりながらマリントルネードを連発されることがあり、この攻撃が来ると反撃すらできなくなる恐れがある。レイクローがあれば迷わず腕を切り落とそう。

シャイニング・タイガード：SFC版ほど強くない。体当たりさえかわせれば、バスターでも戦える。

バーニン・ナウマンダー：ジャンプしてきた時にマリントルネードを当てると、落ちてきたナウマンダーに踏まれる恐れあり。攻撃はかわしやすい。

エレキテル・ナマズロス：壁と天井に電気の弾を這わせる攻撃がかなりやっかい。SFC版より手強いかも。

ワイヤー・ヘチマール：SFC版より弱いが、エクストリームでは赤くなってからの電撃がXの立っている位置を正確に狙ってくるので注意。

ソニック・オストリーグ：SFC版より格段に弱い。バスターでも勝てる。

エクスプローズ・ホーネック：SFC版より大幅に弱体化。小バチに取りつかれることもない。バスターでも余裕で勝てる。

スクリュー・マサイダー：SFC版とパターンは若干違うが、強さは大差無い。

ベルガーダー：強くないが、素早いので体当たりで思わぬダメージを食らうことも。接近戦主体のゼロで戦う時はやや注意。

イーサ＆ソウェル：Σより強いかもしれない、最もやっかいな相手。ゼロは「フィッシュファング」があれば上下の顔を同時に攻撃できるし、ゼットセイバーなら接近する敵を押し返すことができる。Xでは「アルティメットバスター」があれば多少楽だが、弾がかわしづらいので要注意。

ベルカナ：床を針だらけにする弾を食らわなければ問題無い。

ガレス：槍をきっちりかわせれば強くない。ベルカナよりやっかい。

Σ：第一形態はSFC版と同じ要領で勝てる。第二形態は色によってXとゼロを使い分けなければ、片方だけでは絶対に勝てない。